Пробиотични бактерии: ключов играч срещу вируси
Пробиотичните бактерии играят важна роля в поддържането на чревната бариера и могат също така да повлияят положително на собствените имунни клетки на тялото. Те също така са разработили специални механизми за деактивиране на нежелани натрапници, като вируси, например.

Клостридиум дифициле (Clostridium difficile) – „трудната“ бактерия, причинител на антибиотик-асоциирана диария
Clostridium difficile (клостридиум дифициле) е бактерия, която причинява лека до тежка диария и чревни състояния като псевдомембранозен колит (възпаление на дебелото черво). Клостридиум дифициле е най-честата причина за инфекциозна диария в болници и центрове за дългосрочни грижи в много от развитите страни.
COVID 19 и чревният микробиом
Инфекциите с COVID-19 често водят до промяна в чревната флора. Според проучване в списание „Gut“ (2021; DOI: 10.1136/gutjnl-2020-323020), тази промяна е свързана с тежестта на заболяването. Въпреки че коронавирусът засяга предимно дихателните пътища, той може да зарази и клетките на чревната лигавица. Червата са и най-големият имунологичен орган в тялото, чиято задача е да контролира чревните бактерии. Тъй като тежките инфекции с COVID-19 водят до свръхактивност на имунната система, вероятно е засегната и чревната флора.